De Alma Mater State Prison is een staatsgevangenis in het zuidwesten van het Residential District van Anywhere, USA. De gevangenis staat op een eiland, waar je alleen via een ophaalbrug op kunt komen.
"Alma mater" is Latijn en betekent "verzorgende moeder". De term wordt vaak gebruikt om een school of universiteit mee aan te duiden.
Billy Bob Bean wil wraak nemen op acht van de bewakers omdat ze hem het leven zuur gemaakt hebben in de tijd dat hij een celstraf uitzat in de Alma Mater gevangenis. Hij vraagt Claude Speed dan ook deze bewakers te vermoorden in de missie "Penal Ties!". Speed komt de gevangenis binnen door een illegale handelaar in Beany Liquor op te zoeken. Eenmaal binnen krijgt hij van een medegedetineerde, Dizzy "The Hump" Spleen genaamd, een bewakerspasje waarmee Claude Speed een bewakersuniform en een machinegeweer weet te bemachtigen. Hij lost een aantal schoten, en vermoordt de bewakers in de rel die dan ontstaat. Om uit te breken vernielt hij twee generators om de deuren open te krijgen, en springt met een Special Agent Car over de openstaande brug.
Na de missie blijven de deuren van de gevangenis openstaan, waardoor je met een voertuig altijd naar binnen kunt springen. Je krijgt geen wanted level voor het vermoorden van de gevangenen. In multiplayer staan de gevangenisdeuren altijd open en vind je een flamethrower en rocket launcher op het voetbalveld. Buiten de muren bevindt zich een invisibility-pick-up die met wat moeite wel te bereiken is, maar het is onmogelijk om dan weer van het eiland af te komen. Door met een snelle auto schuin op over de ophaalbrug te rijden en zo op de pilaren naast de ingang stunt, kun je de gevangenis ook zonder geopende deuren binnentreden. Je kunt opnieuw enkel wegkomen door jezelf te laten verdrinken in het water.