In Grand Theft Auto IV zijn er een aantal ondergrondse wapenwinkels waar je je wapens zal moeten kopen. Dit kan niet meer bij de gebruikelijke Ammu-Nation-vestigingen uit vorige GTA's, want deze zijn volgens Dimitri Rascalov opgedoekt door de overheid, waardoor deze ondergrondse praktijken de vraag naar wapens opvangen. Je maakt kennis met de wapenwinkels in de missie Do You Have Protection?, en de winkels zijn na het voltooien van deze missie altijd open. Uit de codes van het spel blijkt dat er al eerder wapens worden vrijgespeeld, maar die zijn tot aan introductie van de winkels dus niet te gebruiken. Daarnaast zijn alle wapens ook niet direct beschikbaar, sommige zul je vrijspelen door missies te doen.
De wapenwinkels worden aangegeven met een 
-icoontje op de radar. Ieder groot eiland in GTA IV beschikt over een eigen vestiging, wat een totaal van drie vestigingen op Broker, Algonquin en Alderney maakt. Een plattegrond met de locaties van alle wapenwinkels is hier te vinden.
| Wapen | Prijs wapen | Hoeveelheid kogels en prijs daarvoor | Vrij na missie.. |
|---|---|---|---|
| Armor | $ 500 | n.v.t. | Begin |
| Assault rifle | $ 3.500 | 30 kogels: $ 80 | Deconstruction for Beginners |
| Baseball bat | $ 5 | n.v.t. | Begin |
| Carbine rifle | $ 5.000 | 30 kogels: $ 100 | Three Leaf Clover |
| Combat pistol | $ 1.500 | 9 kogels: $ 100 | Museum Piece |
| Combat shotgun | $ 1.200 | 8 kogels: $ 100 | Blow your Cover |
| Combat sniper | $ 8.500 | 10 kogels: $ 500 | Luck of the Irish |
| Grenade | $ 1.000 | Per stuk: $ 1.000 | Deconstruction for Beginners |
| Micro SMG | $ 1.200 | 50 kogels: $ 100 | Do You Have Protection? |
| Molotov cocktail | $ 500 | Per stuk: $ 500 | The Master and the Molotov |
| Pistol | $ 600 | 17 kogels: $ 35 | Jamaican Heat |
| Pump shotgun | $ 2.500 | 10 kogels: $ 200 | Concrete Jungle |
| RPG | $ 15.000 | Per raket: $ 5.000 | Babysitting |
| SMG | $ 2.500 | 30 kogels: $ 150 | Luck of the Irish |
| Sniper rifle | $ 6.000 | 5 kogels: $ 500 | Luck of the Irish |
Little Jacob
Je wapens hoef je niet alleen te kopen bij deze ondergrondse wapenwinkels. Jacob Hughes oftewel Little Jacob heeft een speciale vaardigheid die je vrij kan spelen als je 75% vriendschap met hem hebt gehaald. Met deze speciale vaardigheid kan je Little Jacob wanneer je maar wil bellen en zal hij je enkele wapens tegen een vriendenprijsje aanbieden. Deze zijn veel goedkoper dan de wapens bij de wapenwinkels. Little Jacob verkoopt echter geen combat pistols, RPG's, baseball bats en sniper rifles (de combat sniper is echter wel te koop bij hem).